উপজেলার সকল জলাশয়কে আধুনিক মাছ চাষের আওতায় আনা, মৎস্য প্রযুক্তি ব্যবহারের মাধ্যমে কর্মসংস্থান সৃষ্টি, মৎস্য সম্পদ সংরক্ষণ ও জীববৈচিত্র্য রক্ষা, মানুষের প্রানিজ আমিষের চাহিদা পূরণ এবং মাৎস্য রফতানি বৃদ্ধি করার উদ্দেশ্যে মৎস্য ও প্রাণিসম্পদ মন্ত্রণালয়ের অধিন মৎস্য অধিদপ্তরের নিয়ন্ত্রাধীন প্রতিটি উপজেলায় ১টি করে উপজেলা মৎস্য অফিস রয়েছে এবং প্রত্যেকটি উপজেলায় একটি করে মৎস্য বীজ উৎপাদন খামার রয়েছে। শালিখা উপজেলা মৎস অফিস, শালিখা, মাগুরা তার একটি। এ কার্যালয়ে ০৩ জন কর্মকর্তা এবং ০৩ জন কর্মচারী রয়েছে।
Planning and Implementation: Cabinet Division, A2I, BCC, DoICT and BASIS